师歌将从红皇后哪里得来的资料和自己已知的生化危机游戏的剧情资料结合了下整理出来生化危机世界的生化历史进程。
恐怕这些资料，这个世界也只有师歌一人知道，其余人也只是知道其中历史一角。
最初，1960年
声名显赫的亚希福特家族（theashford）第六代家主爱德华·亚希福特（edard·ashford）和年轻贵族奥斯威尔·e·斯宾塞（osell·e·senser）在非洲古迪帕亚遗迹内的菊科植物“太阳阶梯”中发现一种古代病毒，病毒能使生物体基因变异，失去意识，并且拥有极强的生命力和抵抗力。鉴于这种病毒的奇异特征，两人决定研究这种病毒，并命名为“始祖病毒”，始祖病毒母体样本诞生。
1963年
由于研究病毒的需要，斯宾塞以未来公司主管的度假别墅为借口，聘请著名建筑师乔治·特列博尔（e·terybour）在美国西部浣熊市（raoncity）的阿克雷山区（arkyounta）建造了内部结构复杂，机关重重的洋馆。四年之后（1967年秋）洋馆完工。斯宾塞随即邀请特列博尔一家前往洋馆度假。
1967年
11月10日
特列博尔的妻子杰西卡（jessica）与女儿丽莎（lisa）进入洋馆，随即被植入始祖病毒变异株tyea型与tyeb型。
11月13日
特列博尔亦被挟持到洋馆遭到软禁。11月16日，杰西卡与病毒融合失败遭到废弃处理，而丽莎却与病毒融合，但却失去理智，袭击供应饮食的女研究员，并剥下她的面皮。11月27日，特列博尔从地下密室逃出，开始寻找出路。但他发现洋馆的结构和他当初设计的并不一样因此无法逃出，最终于11月30日在绝望中死去。
1968年
爱德华·亚希福特，奥斯威尔·e·斯宾塞，詹姆斯·马库斯（jas·arc）三人成立跨国制药企业u
el公司（保护伞公司）。公司表面为财力雄厚，等级森严的制药公司，但在不为人知的背后却进行着病毒的研究和开发。由于找不到稳定病毒的方法，爱德华·亚希福特逐渐忽略打理公司业务，大权逐渐落到斯宾塞手中。
1971年
众多研究员敬仰的同时也是始祖病毒奠基者的爱德华·亚希福特感染病毒去世。其子亚历山大·亚希福特（alexander·ashford）早已取得博士学位，成为了亚希福特家族第七代家主。亚历山大与1970年建造了南极研究所，主要研究基因遗传。然而研究却接连宣告失败，绝望之际他提取了家族创始人亚希福特家族第一代家主维罗尼卡·亚希福特（veronica·ashford）的基因，通过人工授精的方式制造出阿尔弗雷德·亚希福特（alfred·ashford）和阿莱克西亚·亚希福特（alexia·ashford）兄妹，寄希望与培养出智力超群的后代。
此后数年
u
el在世界各地陆续开始建造秘密研究所，进行始祖病毒和新型病毒“t”病毒的各种bo（生化兵器）的开发。公司董事詹姆斯·马库斯于1976年出任浣熊市arky研究所以及新建干部养成所的负责人。
1977年
9月19日
干部养成所。新病毒的研究终于有了成效，在将病毒与水蛭dna结合后达到了马库斯预期的突破，马库斯将其命名为“t”病毒（取自tyrant暴君的第一个字母）。为了完善病毒，马库斯决定放弃啮齿类动物作为研究对象，而改用哺乳类动物，必要时就以人为实验对象。11月15日，马库斯发现有人暗中调查他的研究，并猜到是斯宾塞所为。
1978年
2月11日
实验室入口遭到破坏，马库斯求助于他的得意门生威廉·柏金（illia·birk）和阿尔伯特·威斯克（albert·esker）并且为了夺得主动权而在董事会上公布了“t”病毒。不料斯宾塞早有准备，并指示威廉和威斯克杀掉马库斯。
6月3日
马库斯在研究病毒时被闯进来的特种部队开枪击毙。临死前马库斯看到了威廉和威斯克。马库斯的尸体被冲入下水道。然而水蛭女王的病毒附到他身上，马库斯在无人知晓的情况下以二十年时间复活。
7月31日
对马库斯事件起到重要作用的两人前往阿克雷研究所担任主要研究员，他们是18岁的全才阿尔伯特·威斯克与16岁的天才威廉·柏金。马库斯死亡后，两人便接手“t”病毒的研究。
1981年
7月27日
年仅10岁的天才少女阿莱克茜亚·亚希福特从大学毕业。阿莱克茜亚被u
el分配到南极研究所。由于阿莱克茜亚的存在，导致威廉·柏金几乎疯掉。在过去的3年中“t”病毒的研制基本完成，只有近10的人能免疫，所有人都满足于此成果时，斯宾塞却命令继续研究，直到开发出能毁灭世界的生物兵器，几乎没人知道斯宾塞的目的。威廉受到巨大冲击，疯狂的使用浣熊市的市民进行试验。
1983年
2月17日
阿莱克茜亚的哥哥阿尔弗雷德在南极研究所的密室中了解到自己与妹妹的身世，开始憎恨父亲。3月3日，阿莱克茜亚将始祖病毒与蚁后基因融合，制造出新型“veronicavir”（维罗尼卡病毒），并在阿尔弗雷德帮助下以自己的父亲亚历山大为实验体植入维罗尼卡病毒。
4月22日
维罗尼卡病毒人体实验失败，亚历山大·亚希福特化为危险的怪物诺斯拉图。被监禁于南极基地的地下牢房中。为了彻底完善维罗尼卡病毒，阿莱克茜亚将维罗尼卡病毒植入自己体内，并以冰冻的方式延缓病毒变异造成的智力衰退，由此进入长达十余年的沉睡。阿尔弗雷德回到洛克福德岛（rockford）出任军事训练司令。不久他出现恋妹情节并出现人格分裂症状，所以有关维罗尼卡病毒的研究全部终止。
12月31日
从南极研究所传来阿莱克茜亚由于感染病毒而死亡的消息。至此，威廉·柏金的情绪才恢复正常。而威斯克开始考虑斯宾塞的真实想法，并欲脱离u
el。
1988年
1月
迈克尔·沃伦（ichael·arren）出任浣熊市市长，并且与u
el建立了紧密联系，半数市民都被u
el雇佣。威廉·柏金已经结婚，妻子是同事安奈特·柏金（ante·birk），1986年两人的女儿雪莉·柏金（sherry·birk）此时威廉已经是病毒研究的绝对权威，病毒的研究也进入成熟阶段。按照斯宾塞的构思，带有攻击意识的战斗生命体“tyrant”（暴君）被制造出来了，他拥有一定的智能，能按照编写好的程序执行命令，生命力，抵抗力，攻击能力都比人类强大。但是绝大多数人在植入病毒后会因为脑细胞与病毒融合时衰竭而几乎没有智力。按照基因解析融合模拟实验显示，一千万人中只有一个人能成为tyrant。同年成立的法国分公司正在进行最新的“nesis”计划，这是一种全新思路的生化兵器。nesis是操纵基因而人工创造出来的寄生体，它寄生在寄生体的大脑，强化智能。所以如果把nesis与“t”病毒融合，就能培养出高智能的战斗生物。但是在nesis寄生后大多数生物都因为承受不了5分钟的智力支配就会死亡。所以最后还是只有借助第一个实验体丽莎，进入她大脑的nesis消失了。
1991年
威廉·柏金向公司提出了最新的“gvir”（g病毒），斯宾塞批准开发。丽莎被注射了始祖病毒，以至后来所有的病毒在她身体里都能融合并不断变异，甚至吸收了nesis。威廉正是从丽莎身体中提取出了“g”病毒。“g”的特性是使基因变异，导致宿主的身体结构和细胞结构全部发生改变。而威斯克早已不再关心病毒，他争取到前往浣熊市警局当卧底的机会，暂时脱离了u
el。
1992年
在u
el的经济援助下，浣熊市开始大幅度重建和更新，发展迅速。威廉的新研究所就建在了浣熊市的地下。
1995年
7月31日，威斯克和威廉再次来到伴随他们成长的阿克雷研究所。这里曾是最高级病毒研究所，而“t”病毒就是在这里开发出来的。由于丽莎在吸收了nesis后又开始撕其他女性的面皮，威斯克和威廉为了不使机密泄露而决定销毁丽莎。经过3天的生命停止反映后，丽莎被运到森林里的小木屋里，那里也放着丽莎的母亲杰西卡的棺材。
1996年
一度面临解散的特殊战术及救援特勤部队stars在浣熊市重组，由阿尔伯特·威斯克担任队长。
1998年
5月初
在1978年死于u
el内部斗争的马库斯博士的尸体在水蛭女王和“t”病毒双重影响下重生，以雌雄同体的水蛭人的身份恢复意识，并发誓报复u
el。
5月11日
在马库斯的破坏下阿克雷研究所，干部养成所，地下研究所等地相继发生病毒泄漏事故，工作人员和实验生物相继被感染。阿克雷研究所新主任约翰（john）死亡。
5月14日
浣熊市废弃物处理工厂系统完成。该系统利用特殊瓦斯，化学溶剂与焚化炉来分解各种生化兵器的细胞并销毁处理。
5月20日
阿克雷山区发生第一例生化怪物攻击人类事件。
数天后
浣熊市郊的阿克雷山区附近，连续发生离奇的杀人事件，不少民众在山区附近受到不知名生物的袭击，因而丧失性命。期间相继传出目击犬型怪物的事件。
5月21日
u
el研究员发表最新医学论文，提及在阿克雷山区发现的三种同种异形草药，分别命名为“绿色草药，红色草药，蓝色草药”（游戏中回血道具）。
5月27日
浣熊时报对于年轻女性被猛兽攻击致死之事件以头条加以报导。
6月初
位于浣熊市公园内的秘密实验体销毁场因为研究所运来的尸体数急剧增长，而无法以正常方式处理尸体。
6月16日
大规模的生化怪物出没于山区。
6月30日
瑞贝卡·查姆博斯（rebeachabers）以实地医护人员的身份加入stars的布拉瓦小队（
avo）。
瑞贝卡（生化危机0女主角）
7月9日
警方封锁部分森林，并考虑派遣特别对策部队stars进入山区。
7月中旬
实验体销毁工厂已无法处理数量巨大的尸体，工人们因此被迫暴露在病毒之下工作，部分员工开始呈现被感染症状。同时，安布雷拉公共卫生部常务理事接到总部特别委员会的灾害传真，委员会认为浣熊地区病毒泄露事故可能已经无法控制，该委员会决定严守秘密实验，并防止stars布拉瓦小组和州警介入。
7月22日
合众国海军特种部队少尉比利·科恩（billyen）因被指控在一次非洲执行任务过程中枪杀23人，而被军事法庭判处死刑，经由阿克雷山区押送至leon基地执行。数小时后，押送车辆在阿克雷山区遭受不明怪物攻击，押送人员死亡，比利下落不明。为了避免机密外泄，因此安布雷拉隐藏了情报，企图私下解决此一事件。同时为了进行bo（生化兵器）的实战能力测验，便透过安布雷拉干部威斯卡的安排，引诱stars部队进入灾害地区。
比利·科恩（生化危机0男主角）
7月23日
马库斯博士的复仇计划开始。
当日20点
他指挥水蛭袭击了安布雷拉途经阿克雷山区的列车。
2小时后（生化危机0游戏剧情）
浣熊市警局特殊部队stars的布拉瓦小队，乘坐直升机出动前往阿克雷山区进行调查。由于发动机不明故障，布拉瓦小队（
avo）的直升机在森林里紧急着陆。他们发现了一辆严重损毁的监狱护送车以及被残忍肢解的海军看守的尸体。恩里克·马里尼（enriari），
avo小队的队长，命令进行搜寻比利·柯恩。
avo小队的新成员，瑞贝卡·查姆柏斯，发现了一辆停在森林里的火车并进去调查。火车很显然遭遇过某种事故，乘客无一生还。一个被判定死亡的乘客复活过来攻击瑞贝卡，危难关头囚犯比利·柯恩出现帮了贝瑞卡一把，救了她的命，虽然贝瑞卡对比利心存怀疑，但是为了生存两人决定一起打怪，互相帮助。
之后火车因不明原因突然启动，速度超出安全极限，火车侧翻，二人逃出火车残骸，来到了安布雷拉的干部养成所。
阿尔伯特·威斯克和威廉·博肯获悉了事态的发展。他们前去欲恢复设施，但是计划因怪物的袭击而宣告失败。在监视比利和瑞贝卡进展的同时，他们开始意识到是有人肆意破坏安布雷拉，于是决定炸毁养成所。。
瑞贝卡和比利一路打怪升级，最终见到了复活的马库斯。马库斯向他们讲述了10年前他如何被暗杀的惊人故事。在多年的水蛭研究之后，他刚成功地复制出了t病毒，奥斯威尔·e·斯宾塞的两名雇员，阿尔伯特·威斯克和威廉·博肯，就暗杀了他并窃取了他的研究成果。进化了的水蛭附在了马库斯的尸体上，马库斯的dna被水蛭所吸收，最终他的复制品诞生。
新生的马库斯将t病毒散播在浣熊市森林，以寻求对安布雷拉乃至整个世界的报复，大规模的生化危机由此爆发。当设施的爆炸装置开始倒计时，马库斯的复制体变成了水蛭女王。最终，比例和瑞贝卡成功战胜水蛭女王，干部养成所炸毁，比例和瑞贝卡逃出，因此事件，瑞贝卡放过比利，在报告中写下比利已经死亡，而瑞贝卡接着前往洋馆中进行调查，生化危机0游戏剧情结束。
恐怕这些资料，这个世界也只有师歌一人知道，其余人也只是知道其中历史一角。
最初，1960年
声名显赫的亚希福特家族（theashford）第六代家主爱德华·亚希福特（edard·ashford）和年轻贵族奥斯威尔·e·斯宾塞（osell·e·senser）在非洲古迪帕亚遗迹内的菊科植物“太阳阶梯”中发现一种古代病毒，病毒能使生物体基因变异，失去意识，并且拥有极强的生命力和抵抗力。鉴于这种病毒的奇异特征，两人决定研究这种病毒，并命名为“始祖病毒”，始祖病毒母体样本诞生。
1963年
由于研究病毒的需要，斯宾塞以未来公司主管的度假别墅为借口，聘请著名建筑师乔治·特列博尔（e·terybour）在美国西部浣熊市（raoncity）的阿克雷山区（arkyounta）建造了内部结构复杂，机关重重的洋馆。四年之后（1967年秋）洋馆完工。斯宾塞随即邀请特列博尔一家前往洋馆度假。
1967年
11月10日
特列博尔的妻子杰西卡（jessica）与女儿丽莎（lisa）进入洋馆，随即被植入始祖病毒变异株tyea型与tyeb型。
11月13日
特列博尔亦被挟持到洋馆遭到软禁。11月16日，杰西卡与病毒融合失败遭到废弃处理，而丽莎却与病毒融合，但却失去理智，袭击供应饮食的女研究员，并剥下她的面皮。11月27日，特列博尔从地下密室逃出，开始寻找出路。但他发现洋馆的结构和他当初设计的并不一样因此无法逃出，最终于11月30日在绝望中死去。
1968年
爱德华·亚希福特，奥斯威尔·e·斯宾塞，詹姆斯·马库斯（jas·arc）三人成立跨国制药企业u
el公司（保护伞公司）。公司表面为财力雄厚，等级森严的制药公司，但在不为人知的背后却进行着病毒的研究和开发。由于找不到稳定病毒的方法，爱德华·亚希福特逐渐忽略打理公司业务，大权逐渐落到斯宾塞手中。
1971年
众多研究员敬仰的同时也是始祖病毒奠基者的爱德华·亚希福特感染病毒去世。其子亚历山大·亚希福特（alexander·ashford）早已取得博士学位，成为了亚希福特家族第七代家主。亚历山大与1970年建造了南极研究所，主要研究基因遗传。然而研究却接连宣告失败，绝望之际他提取了家族创始人亚希福特家族第一代家主维罗尼卡·亚希福特（veronica·ashford）的基因，通过人工授精的方式制造出阿尔弗雷德·亚希福特（alfred·ashford）和阿莱克西亚·亚希福特（alexia·ashford）兄妹，寄希望与培养出智力超群的后代。
此后数年
u
el在世界各地陆续开始建造秘密研究所，进行始祖病毒和新型病毒“t”病毒的各种bo（生化兵器）的开发。公司董事詹姆斯·马库斯于1976年出任浣熊市arky研究所以及新建干部养成所的负责人。
1977年
9月19日
干部养成所。新病毒的研究终于有了成效，在将病毒与水蛭dna结合后达到了马库斯预期的突破，马库斯将其命名为“t”病毒（取自tyrant暴君的第一个字母）。为了完善病毒，马库斯决定放弃啮齿类动物作为研究对象，而改用哺乳类动物，必要时就以人为实验对象。11月15日，马库斯发现有人暗中调查他的研究，并猜到是斯宾塞所为。
1978年
2月11日
实验室入口遭到破坏，马库斯求助于他的得意门生威廉·柏金（illia·birk）和阿尔伯特·威斯克（albert·esker）并且为了夺得主动权而在董事会上公布了“t”病毒。不料斯宾塞早有准备，并指示威廉和威斯克杀掉马库斯。
6月3日
马库斯在研究病毒时被闯进来的特种部队开枪击毙。临死前马库斯看到了威廉和威斯克。马库斯的尸体被冲入下水道。然而水蛭女王的病毒附到他身上，马库斯在无人知晓的情况下以二十年时间复活。
7月31日
对马库斯事件起到重要作用的两人前往阿克雷研究所担任主要研究员，他们是18岁的全才阿尔伯特·威斯克与16岁的天才威廉·柏金。马库斯死亡后，两人便接手“t”病毒的研究。
1981年
7月27日
年仅10岁的天才少女阿莱克茜亚·亚希福特从大学毕业。阿莱克茜亚被u
el分配到南极研究所。由于阿莱克茜亚的存在，导致威廉·柏金几乎疯掉。在过去的3年中“t”病毒的研制基本完成，只有近10的人能免疫，所有人都满足于此成果时，斯宾塞却命令继续研究，直到开发出能毁灭世界的生物兵器，几乎没人知道斯宾塞的目的。威廉受到巨大冲击，疯狂的使用浣熊市的市民进行试验。
1983年
2月17日
阿莱克茜亚的哥哥阿尔弗雷德在南极研究所的密室中了解到自己与妹妹的身世，开始憎恨父亲。3月3日，阿莱克茜亚将始祖病毒与蚁后基因融合，制造出新型“veronicavir”（维罗尼卡病毒），并在阿尔弗雷德帮助下以自己的父亲亚历山大为实验体植入维罗尼卡病毒。
4月22日
维罗尼卡病毒人体实验失败，亚历山大·亚希福特化为危险的怪物诺斯拉图。被监禁于南极基地的地下牢房中。为了彻底完善维罗尼卡病毒，阿莱克茜亚将维罗尼卡病毒植入自己体内，并以冰冻的方式延缓病毒变异造成的智力衰退，由此进入长达十余年的沉睡。阿尔弗雷德回到洛克福德岛（rockford）出任军事训练司令。不久他出现恋妹情节并出现人格分裂症状，所以有关维罗尼卡病毒的研究全部终止。
12月31日
从南极研究所传来阿莱克茜亚由于感染病毒而死亡的消息。至此，威廉·柏金的情绪才恢复正常。而威斯克开始考虑斯宾塞的真实想法，并欲脱离u
el。
1988年
1月
迈克尔·沃伦（ichael·arren）出任浣熊市市长，并且与u
el建立了紧密联系，半数市民都被u
el雇佣。威廉·柏金已经结婚，妻子是同事安奈特·柏金（ante·birk），1986年两人的女儿雪莉·柏金（sherry·birk）此时威廉已经是病毒研究的绝对权威，病毒的研究也进入成熟阶段。按照斯宾塞的构思，带有攻击意识的战斗生命体“tyrant”（暴君）被制造出来了，他拥有一定的智能，能按照编写好的程序执行命令，生命力，抵抗力，攻击能力都比人类强大。但是绝大多数人在植入病毒后会因为脑细胞与病毒融合时衰竭而几乎没有智力。按照基因解析融合模拟实验显示，一千万人中只有一个人能成为tyrant。同年成立的法国分公司正在进行最新的“nesis”计划，这是一种全新思路的生化兵器。nesis是操纵基因而人工创造出来的寄生体，它寄生在寄生体的大脑，强化智能。所以如果把nesis与“t”病毒融合，就能培养出高智能的战斗生物。但是在nesis寄生后大多数生物都因为承受不了5分钟的智力支配就会死亡。所以最后还是只有借助第一个实验体丽莎，进入她大脑的nesis消失了。
1991年
威廉·柏金向公司提出了最新的“gvir”（g病毒），斯宾塞批准开发。丽莎被注射了始祖病毒，以至后来所有的病毒在她身体里都能融合并不断变异，甚至吸收了nesis。威廉正是从丽莎身体中提取出了“g”病毒。“g”的特性是使基因变异，导致宿主的身体结构和细胞结构全部发生改变。而威斯克早已不再关心病毒，他争取到前往浣熊市警局当卧底的机会，暂时脱离了u
el。
1992年
在u
el的经济援助下，浣熊市开始大幅度重建和更新，发展迅速。威廉的新研究所就建在了浣熊市的地下。
1995年
7月31日，威斯克和威廉再次来到伴随他们成长的阿克雷研究所。这里曾是最高级病毒研究所，而“t”病毒就是在这里开发出来的。由于丽莎在吸收了nesis后又开始撕其他女性的面皮，威斯克和威廉为了不使机密泄露而决定销毁丽莎。经过3天的生命停止反映后，丽莎被运到森林里的小木屋里，那里也放着丽莎的母亲杰西卡的棺材。
1996年
一度面临解散的特殊战术及救援特勤部队stars在浣熊市重组，由阿尔伯特·威斯克担任队长。
1998年
5月初
在1978年死于u
el内部斗争的马库斯博士的尸体在水蛭女王和“t”病毒双重影响下重生，以雌雄同体的水蛭人的身份恢复意识，并发誓报复u
el。
5月11日
在马库斯的破坏下阿克雷研究所，干部养成所，地下研究所等地相继发生病毒泄漏事故，工作人员和实验生物相继被感染。阿克雷研究所新主任约翰（john）死亡。
5月14日
浣熊市废弃物处理工厂系统完成。该系统利用特殊瓦斯，化学溶剂与焚化炉来分解各种生化兵器的细胞并销毁处理。
5月20日
阿克雷山区发生第一例生化怪物攻击人类事件。
数天后
浣熊市郊的阿克雷山区附近，连续发生离奇的杀人事件，不少民众在山区附近受到不知名生物的袭击，因而丧失性命。期间相继传出目击犬型怪物的事件。
5月21日
u
el研究员发表最新医学论文，提及在阿克雷山区发现的三种同种异形草药，分别命名为“绿色草药，红色草药，蓝色草药”（游戏中回血道具）。
5月27日
浣熊时报对于年轻女性被猛兽攻击致死之事件以头条加以报导。
6月初
位于浣熊市公园内的秘密实验体销毁场因为研究所运来的尸体数急剧增长，而无法以正常方式处理尸体。
6月16日
大规模的生化怪物出没于山区。
6月30日
瑞贝卡·查姆博斯（rebeachabers）以实地医护人员的身份加入stars的布拉瓦小队（
avo）。
瑞贝卡（生化危机0女主角）
7月9日
警方封锁部分森林，并考虑派遣特别对策部队stars进入山区。
7月中旬
实验体销毁工厂已无法处理数量巨大的尸体，工人们因此被迫暴露在病毒之下工作，部分员工开始呈现被感染症状。同时，安布雷拉公共卫生部常务理事接到总部特别委员会的灾害传真，委员会认为浣熊地区病毒泄露事故可能已经无法控制，该委员会决定严守秘密实验，并防止stars布拉瓦小组和州警介入。
7月22日
合众国海军特种部队少尉比利·科恩（billyen）因被指控在一次非洲执行任务过程中枪杀23人，而被军事法庭判处死刑，经由阿克雷山区押送至leon基地执行。数小时后，押送车辆在阿克雷山区遭受不明怪物攻击，押送人员死亡，比利下落不明。为了避免机密外泄，因此安布雷拉隐藏了情报，企图私下解决此一事件。同时为了进行bo（生化兵器）的实战能力测验，便透过安布雷拉干部威斯卡的安排，引诱stars部队进入灾害地区。
比利·科恩（生化危机0男主角）
7月23日
马库斯博士的复仇计划开始。
当日20点
他指挥水蛭袭击了安布雷拉途经阿克雷山区的列车。
2小时后（生化危机0游戏剧情）
浣熊市警局特殊部队stars的布拉瓦小队，乘坐直升机出动前往阿克雷山区进行调查。由于发动机不明故障，布拉瓦小队（
avo）的直升机在森林里紧急着陆。他们发现了一辆严重损毁的监狱护送车以及被残忍肢解的海军看守的尸体。恩里克·马里尼（enriari），
avo小队的队长，命令进行搜寻比利·柯恩。
avo小队的新成员，瑞贝卡·查姆柏斯，发现了一辆停在森林里的火车并进去调查。火车很显然遭遇过某种事故，乘客无一生还。一个被判定死亡的乘客复活过来攻击瑞贝卡，危难关头囚犯比利·柯恩出现帮了贝瑞卡一把，救了她的命，虽然贝瑞卡对比利心存怀疑，但是为了生存两人决定一起打怪，互相帮助。
之后火车因不明原因突然启动，速度超出安全极限，火车侧翻，二人逃出火车残骸，来到了安布雷拉的干部养成所。
阿尔伯特·威斯克和威廉·博肯获悉了事态的发展。他们前去欲恢复设施，但是计划因怪物的袭击而宣告失败。在监视比利和瑞贝卡进展的同时，他们开始意识到是有人肆意破坏安布雷拉，于是决定炸毁养成所。。
瑞贝卡和比利一路打怪升级，最终见到了复活的马库斯。马库斯向他们讲述了10年前他如何被暗杀的惊人故事。在多年的水蛭研究之后，他刚成功地复制出了t病毒，奥斯威尔·e·斯宾塞的两名雇员，阿尔伯特·威斯克和威廉·博肯，就暗杀了他并窃取了他的研究成果。进化了的水蛭附在了马库斯的尸体上，马库斯的dna被水蛭所吸收，最终他的复制品诞生。
新生的马库斯将t病毒散播在浣熊市森林，以寻求对安布雷拉乃至整个世界的报复，大规模的生化危机由此爆发。当设施的爆炸装置开始倒计时，马库斯的复制体变成了水蛭女王。最终，比例和瑞贝卡成功战胜水蛭女王，干部养成所炸毁，比例和瑞贝卡逃出，因此事件，瑞贝卡放过比利，在报告中写下比利已经死亡，而瑞贝卡接着前往洋馆中进行调查，生化危机0游戏剧情结束。